Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A3

Gm2244, Predicted gene 2244, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2244L7N2A3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm2244L7N2A3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2244L7N2A3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2244L7N2A3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2244L7N2A3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms