Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp955bL7N232 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp955bL7N232 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms