Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21798J3QNU5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm21798J3QNU5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm21798J3QNU5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21798J3QNU5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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