Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r12G5E8G1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r12G5E8G1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms