Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm8220F6YKI2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8220F6YKI2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms