Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Crocc2F6XLV1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Crocc2F6XLV1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Crocc2F6XLV1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms