Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17093F6XGJ4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17093F6XGJ4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms