Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms