Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3072F6SKY8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3072F6SKY8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms