Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cald1E9QA15 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cald1E9QA15 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cald1E9QA15 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms