Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3250E9Q1M3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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