Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30dE9PWL0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms