Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5934D3Z4U6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm5934D3Z4U6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5934D3Z4U6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5934D3Z4U6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5934D3Z4U6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5934D3Z4U6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5934D3Z4U6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5934D3Z4U6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm5934D3Z4U6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms