Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkx6-2D3Z4R4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkx6-2D3Z4R4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkx6-2D3Z4R4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkx6-2D3Z4R4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms