Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SafbD3YXK2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SafbD3YXK2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms