Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700015F17RikD3YUK8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms