Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf11cB4XVP9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms