Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrt4B2RU40 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrt4B2RU40 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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