Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ythdc2B2RR83 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ythdc2B2RR83 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ythdc2B2RR83 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms