Protein–RNA interactions for Protein: A3KFM7

Chd6, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd6A3KFM7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd6A3KFM7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd6A3KFM7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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