Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc4a11A2AJN7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc4a11A2AJN7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc4a11A2AJN7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc4a11A2AJN7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc4a11A2AJN7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc4a11A2AJN7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc4a11A2AJN7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc4a11A2AJN7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms