Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhbdl2A2AGA4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhbdl2A2AGA4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms