Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prdm16A2A935 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Prdm16A2A935 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prdm16A2A935 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms