Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trav12-2A0N8N6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms