Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd3A0A140LIW3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd3A0A140LIW3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd3A0A140LIW3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd3A0A140LIW3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd3A0A140LIW3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd3A0A140LIW3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd3A0A140LIW3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd3A0A140LIW3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd3A0A140LIW3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd3A0A140LIW3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms