Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rlbp1Q9Z275 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rlbp1Q9Z275 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.8 ms