Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms