Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lemd3Q9WU40 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms