Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psmb3Q9R1P1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb3Q9R1P1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms