Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM8

Cenph, Centromere protein H, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenphQ9QYM8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenphQ9QYM8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CenphQ9QYM8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms