Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnip3Q9QXT8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnip3Q9QXT8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms