Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trp53inp1Q9QXE4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trp53inp1Q9QXE4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms