Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc5Q9QX29 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc5Q9QX29 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms