Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slamf1Q9QUM4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slamf1Q9QUM4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slamf1Q9QUM4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slamf1Q9QUM4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slamf1Q9QUM4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slamf1Q9QUM4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slamf1Q9QUM4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slamf1Q9QUM4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slamf1Q9QUM4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms