Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssna1Q9JJ94 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssna1Q9JJ94 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms