Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3bQ9ES34 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3bQ9ES34 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms