Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Clstn2Q9ER65 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clstn2Q9ER65 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clstn2Q9ER65 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms