Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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