Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm2aQ9DAR1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm2aQ9DAR1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms