Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2bQ9DAC0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms