Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9DA42 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9DA42 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DA42 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DA42 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DA42 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DA42 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DA42 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DA42 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DA42 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DA42 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9DA42 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9DA42 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9DA42 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DA42 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DA42 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DA42 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DA42 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DA42 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9DA42 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DA42 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DA42 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DA42 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DA42 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DA42 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DA42 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DA42 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DA42 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DA42 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DA42 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DA42 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DA42 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DA42 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DA42 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DA42 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DA42 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DA42 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DA42 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DA42 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DA42 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DA42 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DA42 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DA42 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DA42 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9DA42 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9DA42 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9DA42 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9DA42 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9DA42 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9DA42 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9DA42 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9DA42 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DA42 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DA42 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DA42 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DA42 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DA42 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms