Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf13Q9D777 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms