Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms