Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urm1Q9D2P4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Urm1Q9D2P4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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