Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem88Q9D0N8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88Q9D0N8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms