Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gins3Q9CY94 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gins3Q9CY94 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms