Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd12Q9CWU0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd12Q9CWU0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms