Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc3Q9CW03 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms