Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sppl3Q9CUS9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sppl3Q9CUS9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sppl3Q9CUS9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms