Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sec61bQ9CQS8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms